Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms