Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms