Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTLC3Q9NUV7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms