Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOMER3Q9NSC5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms