Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT84Q9NSB2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms