Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
DUOX2Q9NRD8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DUOX2Q9NRD8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DUOX2Q9NRD8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
DUOX2Q9NRD8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
DUOX2Q9NRD8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DUOX2Q9NRD8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
DUOX2Q9NRD8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms