Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP29Q9HBJ7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
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