Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms