Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
YTHDC2Q9H6S0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
YTHDC2Q9H6S0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms