Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 WWOX-AS1-201ENST00000567099 443 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AC011447.3-205ENST00000592022 1268 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 RNF148-201ENST00000434824 1304 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AC012454.1-201ENST00000443948 995 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 ATOX1-206ENST00000522710 591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms