Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR1EQ9GZS1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms