Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL4Q9C0H6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms