Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTNAP4Q9C0A0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms