Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX6-2Q9C056 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX6-2Q9C056 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX6-2Q9C056 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX6-2Q9C056 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX6-2Q9C056 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX6-2Q9C056 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX6-2Q9C056 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX6-2Q9C056 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX6-2Q9C056 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX6-2Q9C056 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX6-2Q9C056 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX6-2Q9C056 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms