Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.33■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms