Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD1Q9BXT4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms