Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC94Q9BW85 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms