Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PBDC1Q9BVG4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms