Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms