Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RBM42Q9BTD8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBM42Q9BTD8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms