Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms