Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms