Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS4Q9BT78 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms