Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC22CQ9BRL7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC22CQ9BRL7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms