Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms