Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIN2AQ99865 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIN2AQ99865 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIN2AQ99865 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIN2AQ99865 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIN2AQ99865 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIN2AQ99865 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIN2AQ99865 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIN2AQ99865 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIN2AQ99865 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIN2AQ99865 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIN2AQ99865 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms