Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPA33Q99795 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPA33Q99795 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms