Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMD1Q99460 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms