Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CICQ96RK0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms