Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms