Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A9Q96Q91 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms