Protein–RNA interactions for Protein: Q96PT4

DUX3, Putative double homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX3Q96PT4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX3Q96PT4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms