Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms