Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms