Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227BQ96M60 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227BQ96M60 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.2 ms