Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNBD2Q96M20 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms