Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms