Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRIQ1Q96JM4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRIQ1Q96JM4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
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