Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHAMP1Q96JM3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms