Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG1Q96JA1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms