Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLG2Q96I99 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUCLG2Q96I99 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms