Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MS4A3Q96HJ5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms