Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms