Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC1Q96C34 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC1Q96C34 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms