Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD2Q96BF3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms