Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74AQ96AQ1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74AQ96AQ1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74AQ96AQ1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74AQ96AQ1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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