Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO1Q92973 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms