Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRG4Q92954 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms