Protein–RNA interactions for Protein: Q92834

RPGR, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRQ92834 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPGRQ92834 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPGRQ92834 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms