Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GATAD2BQ8WXI9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATAD2BQ8WXI9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms